擅长于泌尿外科及男科疾病的诊治与研究。现担任中华医学会泌尿外科学会名誉主任委员及中华医学会男科学会名誉主任委员，中国计划生育协会副会长、卫生部国际交流中心理事及吴阶平－杨森医药研究评委会主席等职务。作为博士生导师，郭应禄教授注重对泌尿研究生和本领域博士生导师的培养。 多年来从事泌尿外科教学、科研及医疗工作，主要研究方向是尿石症防治，泌尿肿瘤的诊治、腔内泌尿外科技术。在我国肾移植、体外冲击波碎石及腔内泌尿外科的发展中起到牵头促进作用，是泌尿外科和男科新一代学科带头人，获多项科技成果奖。主编专著有《肾移植》、《腔内泌尿外科学》、《泌尿外科腔镜诊断治疗学》、《肾移植进展》《男性不育症》、《前列腺增生及前列腺癌》、《勃起功能障碍的外科治疗》、《男科学》、《前列腺炎》、《前列腺热疗及其衍生疗法》、《临床男科学》等25部著作，并主译《泌尿外科腔内手术图谱》，发表论文300余篇，参加了十余种书籍的编写。获首届吴阶平一杨森医药学研究一等奖，享受政府特殊津贴待遇。 近年来还致力于全国泌尿外科人才工程和全球华人泌尿外科工作者的交流合作。培养了50名博士研究生，在读博士研究生5名、博士后一名。