惠汝太教授回国后率先开展心血管分子遗传学研究，创建了心血管基因组医学专业，探索心脑血管病遗传危险因素，先后找到4个新的心脑血管病遗传危险因素，并首次发现DDAH1多态与缺血中风及冠心病相关，首次提出VEGFR-2危险等位基因增加冠心病，脑中风发病与复发、死亡风险。高血压研究方面，发现血尿酸是高血压的危险因素，建立了单基因高血压的基因诊断方法以及尿变肾上腺素，变去甲肾上腺素的实验诊断方法，并成功应用于临床检测。 迄今培养硕士、博士研究生63人，其中部分学生已经逐渐成为心血管领域的学术带头人。近五年，承担国家级科研项目9项，包括863计划，973计划以及国际合作项目。获得教育部奖励、北京市科学技术奖、中华医学会奖等多次奖励。申请专利28项，其中获得专利授权12项。 惠汝太教授编写著作《高血压病100个怎么办》、《心肌病105个怎么办》、《心血管分子生物学实验技术》以及《高血压防治大讲堂》《健康对话：高血压与心血管疾病专家解疑》，并主编《中国分子心脏病学杂志》，近五年，发表SCI文章65篇，包括Circulation，Circulation Res， J Am Coll Cardiol，Stroke， Cardiovasc Res等心血管领域权威杂志，文章已被引千余次。