自2003年主持医院内科教研室的教学工作以来，多年来致力于研究生及住院医师的教学和进修医生的培训。多次获得北京大学及医学部的表彰，如北京大学优秀教师、北京大学方正奖教金，北京大学医学部优秀教师、北京大学医学部高等教育教学成果奖，以及带领内科教研室获得北京大学医学部继续教育先进集体等多个荣誉称号。 沈琳教授在国内和国际消化系统肿瘤领域享有盛名，在多个学术团体中任重要职务：中央保健委员会第四届中央保健会诊专家，海军保健专家，空军总医院保健专家，中华医学会医疗事故技术鉴定专家库第一届、第二届成员，国家发改委药品价格评审中心药品价格评审专家库成员，中国抗癌协会胃癌专业委员会第三届副主任委员、第四届秘书长，大肠癌专业委员会第三届、第四届常务委员，肿瘤介入学专业委员会第二届委员，中国老年学学会老年肿瘤专业委员会执行委员会第一届副秘书长、第二届常务委员兼副秘书长，中国女医师协会临床肿瘤学专家委员会第一届副主任委员，CSCO血管靶向治疗专家委员会副主任委员，CSCO胃肠间质瘤专家委员会（临床研究协作组）组长等。并在《中华胃肠外科杂志》、《Chinese J Cancer Research》、《中国肿瘤临床与康复》等学术杂志中任编委、副主编或审稿专家。 多次主持并参加国际及国内多中心I/II/III期药物临床研究，特别是组织国内多中心临床研究，多项研究结果成为我国制定消化道肿瘤临床诊疗规范的循证医学依据。先后承担国家自然科学基金、863科技攻关课题、北大医学部985课题、首都医学发展科研基金（联合攻关）、北京市科技计划课题（重点项目）、“十一•五”科技攻关课题、CSCO研究基金及横向课题多项。发表学术论文60余篇