自1965年以来主要从事中西医结合外科急腹症研究与中西医结合防治胆石病、胆道感染的研究，倡导胆病从肝论治学说，确立中医辨证论治为先导的胆石病综合防治体系。认为胆石病非手术治疗不应该是排石或碎石等的单一治疗，而应该在中医辨证论治原则指导下，采用“碎、排、溶、防、切、取”的综合治疗体系，因人、因病而异。在胆石病治疗过程中更注重辨证中药对胆石的预防作用，从源头防止胆石的发生与发展。取得了显著的临床疗效。 先后承担国家科委、国家自然科学基金课题6项，上海市科委、市教委、市卫生局课题12项；注重从肝细胞水平探寻胆病源流，发现中医药辨证论治治疗胆石病不仅仅是一个肝外的排石效应，而是能作用到肝细胞水平，具有综合调理、预防作用。在此基础上研制的符合中医辨证论治规律的“胆宁片”、“升清胶囊”、“养肝利胆颗粒剂”等胆病治疗系列中药制剂，均具有消炎、利胆、排石、溶石、防石、抗肝细胞脂肪变性、清除自由基等综合治疗作用。在国内中医系统中处领先地位。继开发成功上海地区第一个中药新药―胆宁片之后，其更新换代产品升清胶囊也已获得国家新药证书。获得科技成果与进步奖19项，均为第一完成者。发表论文50余篇，编写学术著作与教材4部。由于在科研成果开发方面的优异成就，2次荣获上海市科技创业领军人物。 2002年初龙华医院成立了朱培庭教授工作室，2003年12月朱培庭教授被聘为上海中医药大学朱培庭名中医工作室指导老师。