从事儿童精神病临床、科研和教学工作近30年。对儿童精神疾病的诊疗防治、独生子女健全人格的培养、脑潜能开发、学习困难、儿童青少年行为相关障碍、儿童精神障碍遗传及行为基因学有特殊研究。承担过国家、卫生部及北京市科研课题多项并多次获奖。1995年作为国际抽动症协会会员，曾组织全国进行抽动症研究并获得北京市科技成果三等奖。在美国耶鲁大学从事有关抽动秽语综合征分子遗传学博士后研究。2003年作为主要负责人顺利完成北京自然科学基金资助项目“DRD4基因多态性与抽动秽语综合征遗传易感性研究”(7992020)，首次在汉族TS人群发现了DRD4*7R多态性，为进一步扩展研究奠定了坚实的基础。目前作为主要负责人承担着国家自然科学基金、国家十二五科技支撑项目等多项科研项目。先后发表科研文章80余篇，参编著作20余部，担任两部国家疾病防治指南（ADHD、孤独症）主编。为健康科普广泛传播撰写科普文章200余篇及各种科普书籍10余部，是全国健康科普讲师。 积极投身于教学工作，参编和主编教材多部，多次被评为由首都医科大学优秀教师。其所领导的北京市儿童青少年精神卫生中心是国内领先的儿童精神病学临床、教学、和科研基地，也是我国儿童精神医学对外交流的主要窗口之一，与国外相关学术团体建立和保持了密切的交流和合作关系，并受邀在耶鲁大学（Yale University）和加利福尼亚大学（UCSF）举办讲座。郑毅教授领衔成功取得了2010年“世界儿童青少年精神医学及相关学科大会（IACAPAP）”的申办资格，使世界儿童青少年精神医学最高级别的会议在首都北京成功召开。