朱晓东教授具有全面丰富的心脏外科临床实践经验，在基础科研方面对血液动力学、心脏外科解剖学以及人工心脏瓣膜等有深入研究。1976年在国内首先研制生物瓣膜(心包瓣)并成功用于临床，多次获得国家、卫生部、北京市、医科院的各种奖励和荣誉称号。1988年中央人事部授予有突出贡献的中青年医学科学技术专家称号。1993年获中国医学科学院、中国协和医科大学名医称号。1995年当选为中国工程院院士。 从医40余年来，朱晓东院士亲自施行各类心脏手术4000余例，包括多种疑难重症。同时积极参与建立全国技术协作网在全国推广心脏外科技术。80年代主要致力于在国内推动心脏瓣膜手术，90年代协助国内多家医院开展冠心病外科。他先后主编三部，参编多部专著，发表学术论文130余篇。 朱晓东院士注重干部培养与学术梯队建设，他领导的心脏外科1990年被国家教委定为当时我国唯一的心脏外科专业重点学科点。曾多次应邀出国进行学术交流，介绍我国心脏外科成就。1980年于马尼拉、1985年于瑞士、近年来在伊朗、阿塞拜疆、美国、澳大利亚等国进行学术交流，受到国外同行的重视。1988年被接受为世界外科学会会员。现任中国医学科学院，阜外医院外科系统管理委员会首席专家。中华医学会胸心血管外科学会第四、第五届主任委员。湖南大学、湘雅医学院附院首席科学家，并曾任国内多家医院的技术顾问等多种社会职务。