医院始建于1954年，从院本部单体原有53亩土地，拓展到拥有1个特大型三级甲等医院（在建），1个三级甲等医院，3个二级综合性分院（蜀山分院、庐阳分院、医学美容分院）、3个体检中心（省内规模最大的市体检保健中心、合肥市体检站、市一院健康管理中心）、3个门诊部（太湖路门诊部、琥珀门诊部、政务中心门诊部），1个宾馆组成的综合性医院，医院总占地300余亩，医疗建筑面积约40万平方米（部分在建），拟开放总床位数4000张，已开放床位数1600张，年门诊量70万人次，年住院人数4万人次，医院设90个临床、医技、专科及诊疗中心，博士40余名，硕士300余名，教授、副教授逾百人，是一所集医疗、教学、科研、保健、预防、康复、急救、健康检查、临终关怀为一体的大型三级甲等综合性医院。并于2004年率先成立全省首家国有医疗集团。2006年经安徽省政府批准成为安徽医科大学第三附属医院。 本部位于合肥市中心，南北两大门分别位于淮河路、寿春路西段；医院以“开放的院区、封闭的病区”重新设置院内格局，一条环院大道，两座大门，三个广场，四块网络，五处花园，六幢大楼相互连接，使医院成为省城人民心中的“公园式的医院、宾馆式的医院，温馨化的医院、诚信化的医院。”医院专科门类齐全，设有83个临床医技科室，内设4个临床研究室，20个诊疗中心；现拥有安徽省重点发展学科1个、省特色专科3个，合肥市重点学科6个、市重点扶持学科2个，院内重点学科10个。医院技术力量雄厚，医疗设备先进，拥有16排螺旋CT、大C臂、小C臂、MRI、DSA、CR、DR、心脏彩超、腹部彩超，全自动生化分析仪、微生物培养+鉴定系统、5分类血细胞分析仪、骨质疏松治疗仪、钬激光、超声聚焦刀、氩氦刀、粒子内放射系统、全身热疗系统、准分子激光磨削系统等大型医疗设备。