有国家三级实验室1个、省二级实验室7个、省卫生厅重点实验室1个；国家中医药管理局重点研究室1个、国家中医药管理局重点研究室（临床基地建设单位）1个、省级研究室16个（其中4个为省级重点研究室）。有国家中医药管理局重点学科15个（中医脑病学、中医心病学、中医肺病学、中医骨伤科学、推拿学、针灸学、中医儿科学、中医眼科学、中医耳鼻喉学、中医神志病学、中医全科医学、中医络病学、中医预防医学、中医康复学、中西医结合临床），省教育厅重点一级学科2个（中医学、中西医结合），省中医药管理局重点建设学科7个（中医内分泌学科、中医肛肠学科、中医康复学科、中西医结合临床学科、中医儿科学科、中西医结合基础学科、中医眼科学科）。同时，还配备现代化大型诊疗设备，如：核磁共振、CT、CR、DR、数字胃肠机、全自动生化分析仪、免疫分析仪、彩色多普勒超声诊断仪、电子纤维窥镜、多参数心脏监护系统、血液透析机、体外冲击波碎石机、微波治疗机、多普勒诊断仪、眼底氩激光仪、前列腺气化电切镜、超声聚焦刀等。 　　按照“中医医疗为主、西医保驾护航”的医疗工作思路，医院中医特色明显，优势突出。脑病科、心病科是国家中医临床研究基地优势病种的承建科室。秉承国医大师任继学学术思想，在中医药治疗中风病、痴呆、不寐、胸痹、心律失常等领域，在全国处于领先水平。儿科在王烈教授学术思想指引下，中医药治疗小儿哮喘、紫癜、肺炎等闻名全国，是目前最火的科室。中医药治疗肺病、糖尿病、肾病、肝脾胃病、老年病、风湿病、肿瘤血液病等特色突出，疗效显著。妇科秉承杨宗孟教授学术思想，中医药治疗不孕症、宫血等疗效显著。骨伤科在刘柏龄教授带领下，中医治疗骨病骨伤方法独到，疗效突出。开展的脊柱矫形、股骨头置换、各种骨折手术，与中医特色疗法相融合，明显缩短患者愈合周期。以中医康复为主的二部，是全国最大的康复机构，和国医堂、传统诊疗中心、针灸科一起，最能体现中医特色优势，由于疗效确切，受到患者欢迎。外科设脑外、泌尿外、胸外、普外和乳甲外科五个区，手术配合中医药疗法，加快康复，预后良好，现为长春市公安伤害和交通肇事唯一指定医疗机构。肛肠科全省建科最早，中医药配合手术疗法，疗效明显。制剂室建于上个世纪70年代，现生产品种95个，处方来自院内名老中医，先后共有105种院内制剂纳入省、市医保目录。其中扶正除疫颗粒在防治SARS、甲流中发挥出重要作用。院内制剂配合专科专病，形成了“专科、专病、专药”的“三专”共同发展。 　　2006年以来，医院坚持“突出中医特色，发挥专科特长，体现时代特点，提高综合实力”的办院方针，牢牢抓住国家扶持中医药事业发展的有力机遇，凭借政策优势，不断深化改革，加强内涵建设，综合实力快速提升，医教研工作协调发展，以学习型、和谐型、研究型现代化中医医院为目标，加快了创建国内一流、国际知名的现代化中医名院的步伐。