北京协和医院建成于1921年，是北京协和医学院的附属医院。1971年，医院曾改名为首都医院，1985年恢复北京协和医院名称。党和政府十分关心这所医院的成长，多次接见医院的专家和领导，对医院的建设、知识分子工作都做过重要指示。由国 务院批准，北京协和医院扩建工程于1995年投入使用，成为医院发展中的一个的里程碑。

现在，北京协和医院是中国协和医科大学的临床医学院，中国医学科学院的临床医学研究所，集医疗、教学科研为一体的综合性医院，是国家卫生部指定的全国疑难病症技术指导中心之一。1991年通过了三级甲等医院的评审，1992年被评为全国卫生系统优等集体。

目前，医院住院床位近2000张，有正副教授及相应职称人员达400余名，有两院院士3名（现在应为4名，原有中科院院士王士真，工程院院士史轶蘩、刘彤华，去年增加了邱贵兴），同时还承担着大量外宾和高干的医疗保健任务。

医院承担八年制协和医科大学的临床教学任务。现有博士后流动站5个，博士点11个，有博士生导师55名，硕士生导师104名。每年接收全国各地来院进修医 师、护士和其它进修人才300余名，并接收部分外国留学生。医院设有自己的护士学校，目前在校生达280人。

医院每年承担、省部级等科研项目100余项，平均每年在和国外 杂志发表论文400余篇，十几年来获科技进步奖15项，其中一等奖二项， 部级奖6项，医科院级奖77项。

医院与世界各国的学术交流频繁，已成立了七个中外合作中心，促进了医院现代化建设和医教研工作的开展。北京协和医院分东、西两个院区，东院区（原协1814和医院）地处东单地区，西院区（原北京邮电总医院）地处西单地区。