二附院是西部地区专业化程度最高的骨科医院，骨科专业细化为创伤骨科、手与显微外科、脊柱外科、小儿骨科、颈椎外科、环骨盆科、骨肿瘤科、关节与运动外科、微创脊柱外科、康复科等10 个专业。实行“多对一”服务模式，手术、治疗、康复一体化服务。在严重脊椎畸形、复杂颈椎损伤、脊椎微创手术、显微组织移植与断肢（指）再植、复杂骨关节损伤修复与重建，小儿先天性骨关节疾病、人工关节置换、骨肿瘤、骨科康复及部分骨科基础研究居自治区领先水平，部分项目达到或接近国内、国际先进水平。 1987 年至今已有29 项科研成果荣获自治区科技进步奖，目前承担自治区科技厅、卫生厅、教育厅等科技成果课题59 项，骨科承担国家级自然科学基金课题11 项，自治区重大科研项目35 项，并有9 篇论文被SCI 收录。 医院投资316 万欧元引进GE 光纤超导1.5T 磁共振、CR、DR 计算机数字成像系统、英国牛津肌电诱发诊断仪、C 型臂X 光机、全自动生化分析仪、血凝分析仪、等离子椎间盘射频消融治疗仪、双能X 线骨密度仪、椎间盘镜、关节镜系统等国际先进的高精尖手术、检验、功能、影像医疗设备。