全院现有在职职工1672人，设有内、外、妇、儿等52个临床科室，药剂科、检验科、放射科、超声诊断科等12个医技科室，以及省心血管病研究所、省老年病研究所、省胃肠研究所、省急诊医学研究所、省核医学研究所等5个研究所。2005年，医院对优势项目进行重新整合，建立福建省心脏介入治疗中心、福建省消化内镜中心、福建省微创外科治疗中心等3个省级医学中心。福建省紧急医疗救援中心，福州市120指挥调度中心以及福建省高压氧、病理、影像医学、急诊、病案等专业质控中心以及全省唯一的宁养院设在我院。省心血管病重点实验室是全省医院系统唯一的省级重点实验室，并获省科技厅资助建设全国第一个心血管病领域的细胞生物学研究平台。 　　医院专业设置齐全，人才梯队完整。全院卫生技术人员1396人，其中高级技术职称200多人、中级职称400多人，医生520人、护士700多人，博士、硕士人才140多人。近年来先后承担15个专业的临床教学任务。目前有博士培养点3个，硕士培养点24个。省心血管病研究所是省科技厅的优先发展单位，消化内科、内分泌科、普外科、骨外科、泌尿外科、肿瘤外科列入省科技厅优先发展学科。心内科、心外科、消化内科被省卫生厅首批列为省医学重点专科，糖尿病专业被列为省领先医疗特色专业。1991年以来承担各级科研项目200多项，其中省级80项，部级3项。获各级科技进步奖160项，其中省部级以上72项，《中国糖尿病患病率调查和糖耐量低多中心前瞻性治疗的研究》获首届中华医学科技奖。2001—2006年，中标各类课题108项，获得科研经费574.10万元，获得科研成果奖32项（二等奖2项），完成国家级、省级继续医学教育60多项。在全国性专科学会任职的专家有15位，在省级各专科学会任职的有53位，先后有10名青年专家分获“省运盛青年科技奖”、“省青年科技奖”、“吴阶平医学研究奖”等奖项。